遺伝子工学に欠かせないGel loading bufferのコストダウンについて考える

目的

 生物系のラボでは日々、核酸電気泳動をしていると思います。この際に必要となる試薬の1つが、Gel loading bufferです。様々なメーカーから市販されていますが、これまたかなり値段の幅があります(笑)。ところが多くの人は、Gel loading buffer自体に拘りがあるわけではなく、ラボにあるものを使用しているのではないでしょうか。特に学生さんなどは、昔からラボで代々使用されているGel loading bufferを言われるがまま使用している方が多いと思いますが、実は高い部類の製品を使用している可能性が高いです。今回は、Gel loading bufferのコストダウンについて記事を書こうと思います。

様々なタイプのGel loading buffer

一口にGel loading bufferといっても色々あります。ここでは簡単に書いてみようと思います。

6xか10x

これはサンプルに対して1/5量いれるのか1/9量いれるのかという違いですね。私は6xのほうを好んで使用しています。何故かというか、10xだと1 ulをアガロースゲル電気泳動へアプライするときにシンドイからです(取れない)。

SDSが入っているかどうか

Gel loading bufferにSDSが入っているかどうかの違いですね。多くの用途ではどっちでも良いかも知れないですが、用途によってはSDSが入っていると都合が悪い場合があります。例えば、核酸となにかの複合体を電気泳動する際にはSDSが入ってると壊れることがあります。私も、過去に悩んだことがありました(笑)。

入っている色素の種類

ほとんどのGel loading bufferには、電気泳動の進行具合を知るための色素が入っています。Bromophenol blue、Xylene cyanol、Orange Gなどが利用されます。これらは移動度が異なるので、少し注意が必要になります。 f:id:kanenashi_kenkyu:20181208154036j:plain f:id:kanenashi_kenkyu:20181208154054j:plain *ニッポンジーンのウェブサイトより

Loading Buffer|遺伝子工学研究用試薬|ニッポンジーン

核酸染色試薬入りかどうか

一部のGel loading bufferには、核酸染色試薬が入っています。所謂、先染めというやつです。サンプルと混ぜて泳動後、即撮影が可能です。私は好みません(笑)。

様々なメーカーのGel loading buffer

 とりあえず、普通のGel loading bufferについてリストアップしてみました。普通のというのは核酸染色なしのタイプと言うことです。ワタシは、1 ulのサンプル量でいつもおこなっていますので表の1/10のコストです。

メーカー 製品名 定価(税抜) 1 sample (10 ulスケール)あたりの単価
タカラバイオ 6× Loading Buffer 11500円(キャンペーン対象外) 2.3円
タカラバイオ 10× Loading Buffer 11500円(キャンペーン対象外) 1.15円
ニッポンジー Loading Buffer 4000円(キャンペーン時; 2400円) 0.4円(キャンペーン時; 0.24円)
ニッポンジー 6 x Loading Buffer Triple Dye 4000円(キャンペーン時; 2400円) 2.6円(キャンペーン時; 1.6円)
ニッポンジー 6 x Loading Buffer Double Dye 4000円(キャンペーン時; 2400円) 2.6円(キャンペーン時; 1.6円)
ニッポンジー 6 x Loading Buffer Orange G 4000円(キャンペーン時; 2400円) 2.6円(キャンペーン時; 1.6円)
ThermoScientific BlueJuice™ Gel Loading Buffer (10X) 6100円(キャンペーン対象外) 2.0円
ThermoScientific DNA Gel Loading Dye (6X) 6900円(キャンペーン対象外) 2.76円
NEB Gel Loading Dye, Purple (6X) 7100円(キャンペーン対象外) 3.55円
Merck Gel Loading Buffer for NA electrophoresis 4500円(キャンペーン対象外) 1.8円
SMOBIO ExcelDye 6X DNA Loading Dye, Orange 7600円(キャンペーン対象外) 1.52円
SMOBIO ExcelDye 6X DNA Loading Dye, Green 7600円(キャンペーン対象外) 1.52円
SMOBIO ExcelDye 6X DNA Loading Dye, Blue 7600円(キャンペーン対象外) 1.52円
SMOBIO ExcelDye 6X DNA Loading Dye, Tri-color 8200円(キャンペーン対象外) 1.64円
東洋紡 6×Loading Dye 1000円(キャンペーン対象外) 2円

(2018年12月現在)

 安さ重視にて探せる範囲でリスト化してみましたが、こう眺めてみると価格差があまりないですね、安い試薬なので。。。ワタシの使っていたものは、タカラバイオ東洋紡→ニッポンジーン→という感じです。ちなみに、Orange Gが好きです。

結局どれがいいの?

 研究費に乏しい貧乏研究者なワタシは、コストダウンを考えた結果、現在はニッポンジーンのOrange Gのものを購入して使用しています。これは、1 runあたり1.6円(1 ulスケールでは0.16円)という安い部類にあります。

使い方

ワタシは、チューブとチップが勿体ないので。。。パラフィルムを少し切って置く→Gel loading bufferを必要量スポットする→サンプルを取る→パラフィルム上で混合→そのまま取ってアガロースゲルにアプライ、という感じで作業しています。チップもチューブも節約できますし、何より作業量が少なくて楽ちんです(笑)。

終わりに

 このように、普段使用する試薬であるGel loading bufferの場合、製品を変更するだけで少しだけコストカットが可能になりました。現在、ワタシは用途によって自作のGel loading bufferを使うか、既製品を使うかを分けています。自作のGel loading bufferはいくら使ってもコストは限りなくゼロに近いので(笑)!レシピは次回の記事で公開したいと思っています。

研究費もマンパワーもないけど、なんとか実験して論文を出していきたいですね。